MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009051	TTA	2	6	206316	206321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009051	CAAC	2	8	206446	206453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_009051	TTA	2	6	206478	206483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009051	TTC	2	6	206531	206536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_009051	AT	4	8	207480	207487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009051	CGG	2	6	207550	207555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_009051	ATCC	2	8	207584	207591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_009051	TTC	2	6	207629	207634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_009051	GC	3	6	207721	207726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_009051	GAA	3	9	207755	207763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009051	A	6	6	207762	207767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009051	TC	4	8	209441	209448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_009051	AT	3	6	209717	209722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009051	TGAG	2	8	209724	209731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009051	TGC	2	6	209756	209761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_009051	AAT	2	6	210299	210304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009051	TAAA	2	8	210314	210321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009051	ATTC	2	8	210322	210329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_009051	T	6	6	211251	211256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009051	C	6	6	211292	211297	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
521	NC_009051	CGG	2	6	211301	211306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_009051	ACG	2	6	212138	212143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009051	TTC	2	6	212191	212196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_009051	GAC	2	6	220326	220331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009051	AAT	2	6	220360	220365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009051	ATC	2	6	221411	221416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_009051	G	6	6	221456	221461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009051	TC	3	6	222280	222285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_009051	TTG	2	6	222318	222323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009051	GGA	2	6	222336	222341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009051	ACGC	2	8	222374	222381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_009051	GAA	2	6	222390	222395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009051	TCCC	2	8	225400	225407	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
534	NC_009051	CG	3	6	225434	225439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_009051	C	6	6	225444	225449	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
536	NC_009051	TCC	2	6	225450	225455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_009051	CCG	2	6	225458	225463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_009051	GGC	2	6	225485	225490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_009051	CCAT	2	8	225553	225560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_009051	CGT	2	6	225633	225638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_009051	GCGG	2	8	225669	225676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
542	NC_009051	GAG	2	6	225677	225682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009051	A	8	8	226190	226197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009051	GGA	2	6	226270	226275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009051	CGG	2	6	226299	226304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009051	TCA	2	6	226308	226313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_009051	TAC	2	6	226363	226368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009051	GTTG	2	8	226463	226470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009051	CGGC	2	8	226506	226513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_009051	T	6	6	226548	226553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009051	GAG	2	6	226610	226615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009051	TA	3	6	229063	229068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009051	CCG	2	6	229085	229090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_009051	GC	3	6	229493	229498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_009051	CT	3	6	231079	231084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_009051	GCG	2	6	231116	231121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_009051	CGC	2	6	231142	231147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_009051	TCT	2	6	232660	232665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_009051	GAA	2	6	234363	234368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009051	TCT	2	6	234564	234569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009051	CT	3	6	234596	234601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_009051	GAG	2	6	234637	234642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009051	G	6	6	234654	234659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009051	GCCG	2	8	234667	234674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_009051	GGTGA	2	10	234791	234800	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009051	GCC	2	6	234978	234983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_009051	C	6	6	234982	234987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
568	NC_009051	ACA	2	6	234988	234993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_009051	TCT	2	6	234996	235001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009051	GT	4	8	235011	235018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009051	TCG	2	6	235285	235290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_009051	CCCT	2	8	238571	238578	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
573	NC_009051	TGGAC	2	10	238602	238611	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
574	NC_009051	ATT	2	6	238623	238628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009051	GCCG	2	8	240530	240537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_009051	CTC	2	6	241607	241612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_009051	TTC	2	6	241617	241622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_009051	AGGGG	2	10	241834	241843	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009051	GCCCCC	2	12	241977	241988	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
580	NC_009051	GAG	2	6	242001	242006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009051	TGGGG	2	10	242020	242029	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009051	AGGGG	2	10	242060	242069	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009051	G	7	7	242066	242072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009051	GAA	2	6	242083	242088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009051	TTC	2	6	242094	242099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_009051	TTCGC	2	10	242105	242114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
587	NC_009051	C	6	6	242116	242121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
588	NC_009051	TTC	2	6	242128	242133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_009051	GCTCC	2	10	242185	242194	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
590	NC_009051	TCGCAC	2	12	242204	242215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
591	NC_009051	TCGCT	2	10	242231	242240	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
592	NC_009051	CCA	2	6	242417	242422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_009051	AC	3	6	242455	242460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_009051	GT	4	8	242469	242476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009051	CAC	2	6	242510	242515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_009051	A	6	6	242527	242532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009051	CA	3	6	244913	244918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_009051	CT	3	6	244946	244951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_009051	CCG	2	6	245003	245008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_009051	G	7	7	245060	245066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009051	GTG	2	6	245127	245132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009051	GAA	2	6	245148	245153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009051	TGC	2	6	246105	246110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_009051	GAT	2	6	248281	248286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009051	TC	3	6	248338	248343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_009051	CCCGC	2	10	248405	248414	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
607	NC_009051	G	6	6	248432	248437	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009051	GACTA	2	10	248537	248546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
609	NC_009051	CTC	2	6	248687	248692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_009051	GAA	2	6	248756	248761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009051	GAA	2	6	248771	248776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009051	TCC	2	6	250408	250413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_009051	TA	3	6	250442	250447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009051	CGG	2	6	250492	250497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_009051	GCC	2	6	250515	250520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_009051	CGC	2	6	250561	250566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_009051	CCG	2	6	250569	250574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_009051	A	7	7	250594	250600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009051	TA	3	6	253575	253580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009051	GCA	2	6	253590	253595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_009051	CAGG	2	8	258503	258510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
622	NC_009051	TTC	2	6	258532	258537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_009051	C	6	6	258546	258551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
624	NC_009051	CGTT	2	8	258576	258583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_009051	GAT	2	6	258598	258603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009051	AGA	2	6	258606	258611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009051	CGG	2	6	258630	258635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_009051	TCC	2	6	258713	258718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_009051	CT	3	6	258719	258724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_009051	GCG	2	6	258818	258823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_009051	TCA	2	6	259429	259434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_009051	AGG	2	6	259455	259460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009051	AG	4	8	267735	267742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009051	CTC	2	6	268983	268988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_009051	TC	3	6	268995	269000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_009051	GCACG	2	10	269022	269031	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
637	NC_009051	CGG	2	6	269055	269060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_009051	TGC	2	6	269079	269084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_009051	TAA	2	6	269109	269114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_009051	TGA	2	6	269142	269147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_009051	G	7	7	269184	269190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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